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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  37 lines
  1. **************************************************************
  2. * Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor signature *
  3. **************************************************************
  4.  
  5. Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor  (GM-CSF) [1,2] is a cytokine
  6. that acts in hematopoiesis by  stimulating  the growth  and differentiation of
  7. hematopoietic  precursor cells from various lineages,  including granulocytes,
  8. macrophages, eosinophils and erythrocytes.
  9.  
  10. GM-CSF is a glycoprotein of  about  120 amino acid residues that contains four
  11. conserved cysteine  residues involved in  two disulfide bonds, as shown in the
  12. following schematic representation.
  13.  
  14.                                                    +---------------+
  15.                                                    |               |
  16.         xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCxxxxxxxxxxxxxxxxCxxxCxxxxxxxxxxxCxxx
  17.                                   |                *****
  18.                                   +--------------------+
  19.  
  20. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  21. '*': position of the pattern.
  22.  
  23. As a signature pattern, we selected the region  that  includes  the second and
  24. third conserved cysteines.
  25.  
  26. -Consensus pattern: C-P-P-T-x-E-T-x-C
  27.                     [The two C's are involved in disulfide bonds]
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30. -Last update: October 1993 / Pattern and text revised.
  31.  
  32. [ 1] Morstyn G., Burgess A.W.
  33.      Cancer Res. 48:5624-5637(1988).
  34. [ 2] Walter M.R., Cook W.J., Ealick S.E., Nagabhushan T.L., Trotta P.P.,
  35.      Bugg C.E.
  36.      J. Mol. Biol. 224:1075-1085(1992).
  37.